Родился в крестьянской семье с. Ставки Хащеватской волости Гайсинского уезда Каменец-Подольской губернии в 1880 г. Крестили Онуфрия в храме Рождества Пресвятой Богородицы. В родном селе он закончил церковно-приходскую школу, а затем курсы подготовки учителей. По окончании курсов Онуфрий распоряжением Гайсинского уездного отделения учительского совета Каменец-Подольской епархии 14.06.1901 г., был назначен помощником учителя в церковно-приходскую школу родного села. В 1907 г. Онуфрия Ивановича назначили учителем в школу грамоты села Ставки. Вскоре он женился на своей односельчанке – Хионии Моисеевне Андроник. Всего в семье Кружилко родилось 6 детей.
В селе Ставки, где жило семейство, земельный вопрос стоял очень остро. Село разрасталось, а свободных земель не было. Во время столыпинской земельной реформы несколько семей из села написали прошение на выделение земель в Сибири (эти территории включали в себя также Казахстан, Киргизию и Дальний Восток) и просили разрешения на переселение. Зимой 1909-1910 гг. семьи Кружилко и Андроников переехали в указанное им место – Кустанайский уезд Тургайской области Оренбургской губернии.
1 августа 1910 г., на время отлучки местного псаломщика-дьякона, по распоряжению епархиального начальства, Кружилко Онуфрий Иванович был назначен исполняющим должность псаломщика при разъездном священнике в Кустанайском уезде. Священник и псаломщик походной церкви ездили по поселкам переселенцев и совершали службы, крестили детей, отпевали умерших и т.п.
9 мая 1911 г. резолюцией преосвященного Дионисия, епископа Челябинского, Онуфрий Иванович был назначен исполняющим должность псаломщика в храм свв. бессребр. Космы и Дамиана в пос. Джусалинский Актюбинского уезда Оренбургской губернии (сейчас – п. Жусалы Каргалинского района Актюбинской области). 11 января 1913 г. Онуфрий Иванович был утвержден в должности псаломщика. В Оренбургских епархиальных ведомостях псаломщик Актюбинского городского благочинического округа Онуфрий Кружилко упоминается как жертвователь на образование стипендии при духовных учебных заведениях Оренбургской епархии в честь 300-летия Царствования Дома Романовых.
В период 1922-1923 гг. о. Онуфрий был рукоположен в сан диакона и направлен на приход Покрова Богородицы в пос. Родниковский Актюбинского уезда. В 1925-м и 1927 гг. диак. Онуфрий подвергался преследованиям советской власти, был лишен избирательных прав.
Несмотря на гонения, о. Онуфрий принимает священнический сан и отправляется служить в храм Покрова Богородицы пос. Березовка Актюбинского уезда. В декабре 1927 г. священник Онуфрий был переведен в храм Казанской иконы Божией Матери пос. Кос-Истек Актюбинского уезда, где ему пришлось пережить новую волну гонений.
В 1929 г. о. Онуфрий был судим за невыполнение индивидуального налогообложения – плана хлебозаготовки. В октябре 1930 г. о. Онуфрия снова привлекли к суду, конфисковали имущество и арестовали. Через 3 месяца о. Онуфрий был приговорен к двум годам лишения свободы с высылкой за пределы Актюбинского округа сроком на 5 лет.
Свой срок о. Онуфрий отбывал в «Акмолаге» – работал на прокладке железной дороги в районе озера Балхаш, где заключенные вручную рубили скалы. Железную дорогу к месторождению медной руды и обслуживанию металлургического комбината строили с 1929-го по 1935 гг.
В августе 1934 года безнадежно больного о. Онуфрия привезли в пос. Акбулак Оренбургской области, где жила матушка Хиония с тремя малолетними детьми в саманном доме – «землянке», которая представляла из себя узкое, длинное и холодное здание. В диагнозе, поставленном о. Онуфрию, было написано: «Тропическая лихорадка». Но он кашлял кровью – это был туберкулез или осложнение после воспаления легких. Недолго промучившись, 54-летний о. Онуфрий скончался 16 октября 1934 г. Здесь же, в Акбулаке, он и был похоронен.
Через несколько лет м. Хиония была похоронена рядом со своим мужем. Это была храбрая и преданная женщина, которая самоотверженно следовала за о. Онуфрием, несмотря на все скорби и испытания. После его ареста и скоропостижной смерти она не пала духом, а наоборот, стала опорой своим подрастающим детям.
